Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

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Length 679 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fv4P11370 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fv4P11370 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fv4P11370 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fv4P11370 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fv4P11370 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Fv4P11370 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fv4P11370 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fv4P11370 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fv4P11370 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fv4P11370 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fv4P11370 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fv4P11370 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fv4P11370 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fv4P11370 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fv4P11370 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fv4P11370 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Fv4P11370 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Fv4P11370 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Fv4P11370 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms