Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Hoxd4P10628 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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