Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P10404 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P10404 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P10404 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
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