Protein–RNA interactions for Protein: P09092

Hoxa6, Homeobox protein Hox-A6, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa6P09092 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Hoxa6P09092 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Hoxa6P09092 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms