Protein–RNA interactions for Protein: P01790

Ig heavy chain V region M511, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01790 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
P01790 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
P01790 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01790 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01790 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01790 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01790 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01790 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01790 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01790 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01790 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01790 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01790 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
P01790 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
P01790 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms