Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P01680 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
P01680 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms