Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Col5a1O88207 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Col5a1O88207 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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