Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gdpd5-208ENSMUST00000213887 2711 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ldb2O55203 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ldb2O55203 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ldb2O55203 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb2O55203 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
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