Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E2f6O54917 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
E2f6O54917 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms