Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
EdaO54693 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
EdaO54693 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EdaO54693 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
EdaO54693 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EdaO54693 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
EdaO54693 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms