Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Clk2O35491 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms