Protein–RNA interactions for Protein: O35348

Colq, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, mousemouse

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Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ColqO35348 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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ColqO35348 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm14993-201ENSMUST00000121180 164 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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ColqO35348 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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ColqO35348 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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ColqO35348 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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ColqO35348 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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ColqO35348 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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ColqO35348 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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ColqO35348 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
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ColqO35348 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Snx7-205ENSMUST00000198499 1314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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ColqO35348 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
ColqO35348 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
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ColqO35348 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
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ColqO35348 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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ColqO35348 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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ColqO35348 A730082K24Rik-201ENSMUST00000205365 465 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
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ColqO35348 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
ColqO35348 AC107711.3-201ENSMUST00000228939 1035 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms