Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Kcns1O35173 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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