Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Sec22bO08547 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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