Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Gm20878L7N244 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Sssca1-201ENSMUST00000025885 693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Rad54b-203ENSMUST00000108306 652 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Gm20878L7N244 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms