Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm8888J3QPX5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms