Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Tmem200cJ3QK46 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms