Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Gm43135-201ENSMUST00000196442 3462 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Kat6a-201ENSMUST00000044331 9113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Tmem248-201ENSMUST00000065329 3607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Lipc-201ENSMUST00000034731 1920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Agl-208ENSMUST00000162792 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Mtbp-201ENSMUST00000022998 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Serpina3n-201ENSMUST00000021506 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Plch1-203ENSMUST00000084105 6245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Adgrb3-207ENSMUST00000151309 5448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Mir9-3hg-202ENSMUST00000181511 3412 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm38252-201ENSMUST00000192701 2616 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm43872-201ENSMUST00000203218 2213 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 AC153955.4-201ENSMUST00000217069 2752 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Rpa1-201ENSMUST00000000767 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Scml4-202ENSMUST00000105494 4166 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Rims2-201ENSMUST00000042917 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cntn5-205ENSMUST00000179049 2682 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Dcp1a-201ENSMUST00000022535 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Mink1-204ENSMUST00000102558 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 5730596B20Rik-201ENSMUST00000070587 3354 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Zcchc18-203ENSMUST00000113067 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 A530041M06Rik-201ENSMUST00000199690 2288 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Zwilch-211ENSMUST00000176794 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Chn2-202ENSMUST00000067741 2983 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Slc26a8-201ENSMUST00000114764 3670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Uvssa-204ENSMUST00000202816 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm40055-201ENSMUST00000196091 2742 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 St5-202ENSMUST00000079282 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cdca2-205ENSMUST00000150006 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Mical1-201ENSMUST00000019967 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Trim9-211ENSMUST00000223160 3574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm29472-201ENSMUST00000188599 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Dock8-201ENSMUST00000025831 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ap5m1-201ENSMUST00000037473 6321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Olfr1340-202ENSMUST00000213436 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ddx25-201ENSMUST00000034612 6934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm5182-201ENSMUST00000217708 6092 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ick-204ENSMUST00000118869 2540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Mmrn2-201ENSMUST00000111908 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm30655-201ENSMUST00000220498 1383 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm3550-201ENSMUST00000105038 1656 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Serping1-202ENSMUST00000111641 1665 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Fto-201ENSMUST00000069718 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm42603-201ENSMUST00000199893 2146 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Zfp873-203ENSMUST00000209622 2284 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Rapgef5-206ENSMUST00000222185 5508 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ect2l-204ENSMUST00000208948 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Scn2a-205ENSMUST00000200829 6348 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Gm10384-201ENSMUST00000100713 2046 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Etl4-205ENSMUST00000114607 3055 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Adgrl3-213ENSMUST00000120292 5026 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Gm20538F6Z9R1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms