Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Dppa3-ps-201ENSMUST00000116499 451 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm24933-201ENSMUST00000103762 110 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm23252-201ENSMUST00000103776 110 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm26443-201ENSMUST00000179610 110 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm45783-201ENSMUST00000210877 656 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Fndc1E9Q043 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms