Protein–RNA interactions for Protein: E9PZP8

Herc1, HECT and RLD domain-containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 4,859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc1E9PZP8 Gm20474-201ENSMUST00000180089 596 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm38258-201ENSMUST00000191792 675 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm10080-201ENSMUST00000075585 438 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Fsip1-202ENSMUST00000028821 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gstp3-202ENSMUST00000189808 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm8960-201ENSMUST00000219787 788 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 AC105950.2-201ENSMUST00000220938 368 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 3110009E18Rik-202ENSMUST00000056038 401 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm45847-201ENSMUST00000209402 1880 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Stard4-202ENSMUST00000118990 648 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm16118-201ENSMUST00000161914 680 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Spp2-202ENSMUST00000176708 710 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm2021-201ENSMUST00000190623 464 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 1700102F20Rik-201ENSMUST00000203859 670 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 6430531B16Rik-205ENSMUST00000210254 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm30619-201ENSMUST00000213962 686 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Spp2-201ENSMUST00000027518 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Tmx2-202ENSMUST00000111664 1926 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Slamf9-201ENSMUST00000027830 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm42589-201ENSMUST00000199097 1751 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm15083-201ENSMUST00000138670 1413 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Rhox3f-201ENSMUST00000115172 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm8661-201ENSMUST00000118688 992 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Rhox3f-203ENSMUST00000184451 1008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm19927-201ENSMUST00000185792 781 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 AC133517.1-201ENSMUST00000225825 594 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Snora57-201ENSMUST00000093658 148 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Cox7a1-201ENSMUST00000098594 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Gm7061-201ENSMUST00000118127 1416 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Herc1E9PZP8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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