Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Poc1a-201ENSMUST00000072206 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms