Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Clrn2B2RVW2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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