Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
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Rd3lB2RV38 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rd3lB2RV38 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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