Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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PtprbB2RU80 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PtprbB2RU80 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
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