Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Brpf3B2KF05 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms