Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trabd2bB1ATG9 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms