Protein–RNA interactions for Protein: A2ASQ1

Agrn, Agrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,950 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AgrnA2ASQ1 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AgrnA2ASQ1 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AgrnA2ASQ1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AgrnA2ASQ1 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AgrnA2ASQ1 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AgrnA2ASQ1 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AgrnA2ASQ1 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AgrnA2ASQ1 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AgrnA2ASQ1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AgrnA2ASQ1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AgrnA2ASQ1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AgrnA2ASQ1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AgrnA2ASQ1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
AgrnA2ASQ1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AgrnA2ASQ1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
AgrnA2ASQ1 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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AgrnA2ASQ1 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
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AgrnA2ASQ1 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Arhgef33-207ENSMUST00000224966 490 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
AgrnA2ASQ1 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms