Protein–RNA interactions for Protein: A2AGT5

Ckap5, Cytoskeleton-associated protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap5A2AGT5 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ckap5A2AGT5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap5A2AGT5 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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