Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
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PtprfA2A8L5 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PtprfA2A8L5 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms