Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Ilf3Q9Z1X4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms