Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Cldn9Q9Z0S7 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Cldn9Q9Z0S7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Cldn9Q9Z0S7 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cldn9Q9Z0S7 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cldn9Q9Z0S7 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cldn9Q9Z0S7 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cldn9Q9Z0S7 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cldn9Q9Z0S7 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cldn9Q9Z0S7 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Cldn9Q9Z0S7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Cldn9Q9Z0S7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Cldn9Q9Z0S7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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