Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Cldn13Q9Z0S4 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Cldn13Q9Z0S4 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Cldn13Q9Z0S4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Cldn13Q9Z0S4 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Cldn13Q9Z0S4 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Cldn13Q9Z0S4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn13Q9Z0S4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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