Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV85

Nme3, Nucleoside diphosphate kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme3Q9WV85 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nme3Q9WV85 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Gm14340-201ENSMUST00000148700 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nme3Q9WV85 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms