Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Clcf1Q9QZM3 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Clcf1Q9QZM3 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Clcf1Q9QZM3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Clcf1Q9QZM3 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms