Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Trappc2lQ9JME7 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms