Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Rabgef1Q9JM13 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
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