Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Nnmt-202ENSMUST00000119426 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm28901-201ENSMUST00000188810 474 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Col5a3Q9JLI2 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms