Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJT2

Gfra4, GDNF family receptor alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra4Q9JJT2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Oprm1-211ENSMUST00000105602 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Mir3060-201ENSMUST00000175339 83 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Gfra4Q9JJT2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms