Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
OtofQ9ESF1 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
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