Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
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Tspan4Q9DCK3 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tspan4Q9DCK3 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
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Tspan4Q9DCK3 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tspan4Q9DCK3 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms