Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pus10Q9D3U0 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pus10Q9D3U0 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pus10Q9D3U0 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pus10Q9D3U0 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pus10Q9D3U0 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pus10Q9D3U0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Pus10Q9D3U0 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Pus10Q9D3U0 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Pus10Q9D3U0 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pus10Q9D3U0 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pus10Q9D3U0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pus10Q9D3U0 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Pus10Q9D3U0 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pus10Q9D3U0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Pus10Q9D3U0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Pus10Q9D3U0 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pus10Q9D3U0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pus10Q9D3U0 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pus10Q9D3U0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pus10Q9D3U0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pus10Q9D3U0 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Pus10Q9D3U0 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Pus10Q9D3U0 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Pus10Q9D3U0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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