Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3S3

Snx29, Sorting nexin-29, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx29Q9D3S3 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Snx29Q9D3S3 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms