Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Pramef12Q9D2F1 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms