Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Reps1-201ENSMUST00000126390 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Trappc6bQ9D289 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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