Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc47Q9D024 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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