Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rhobtb3Q9CTN4 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms