Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Rprd1bQ9CSU0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms