Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV3

Mrpl42, 39S ribosomal protein L42, mitochondrial, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl42Q9CPV3 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Timd2-202ENSMUST00000109225 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Camkk1-201ENSMUST00000092937 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Mrpl42Q9CPV3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms