Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm11858-201ENSMUST00000117935 838 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm23884-201ENSMUST00000122687 294 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Olfr1537-201ENSMUST00000073248 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Olfr183-204ENSMUST00000214831 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 AL589696.1-201ENSMUST00000225711 330 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Stap1-201ENSMUST00000031171 909 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Klrk1-201ENSMUST00000032252 1270 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Ms4a4dQ99N05 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms