Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atp1b4Q99ME6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atp1b4Q99ME6 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms